虽然郑芝龙一再的击败刘香，但是始终不能歼灭刘香；而刘香也是一个聪明人，他知道，想要在正面击败郑芝龙实在是太困难了，于是乎刘香就转换战术，不再与郑芝龙正面交锋，转而攻击大明沿海各地。
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刘香战术的转变给郑芝龙带来了极大的麻烦，而郑芝龙现在实在是没有功夫搭理这个四处煽风点火的刘香，作为纵横海上数十年，和无数洋人打过交道一代海枭，郑芝龙十分清楚西班牙的海上实力，所以郑芝龙将绝大部分的精力都集中在扩充实力，整训士卒上面了，而郑芝龙的这种做法，实际上也在一定程度上纵容了刘香的这种行为。
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郑芝龙整军备战，刘香肆虐吕宋、闽、粤、台等大明沿海各地，这下之靠着海上贸易营生的各大商帮、江南世家可就坐不住了。原先商船出海，只要付清出关的关税，然后在给郑芝龙这个“地头蛇”一笔“保安费”，在南中国海这个地方就可以安安全全的做生意。
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但是原本被郑芝龙打得奄奄一息的刘香突然回魂了，不仅仅骚扰沿海各地，而且还要劫掠商船，强收“保护费”，要是收取的“保护费”要是能低廉一点的话，那这些商帮、江南世家也就认了，但是刘香太黑了，收费收的太狠了，实在是让这些人忍受不了了，但是要是不交的话，那就是船毁、货没、人死。
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于是乎这些商帮、江南世家先是找郑芝龙，说郑将军，我们都是交了“保护费”的，不过眼下海路可不是很顺畅啊，你得出面管一管啊，要不然咱们的关系，那可就要在重新商量一下了啊。
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郑芝龙也明白，这些人是不太好往死里得罪的，所以郑芝龙非常大度的接待了这些商帮、江南世家的代表，对于这些代表提出的质询，郑芝龙也难得的回答这些代表的质询，郑芝龙表示，因为西班牙人的报复行动在即，所以水师正在集训，准备与西班牙人决一死战，只要打垮了西班牙人，往后在南中国海就咱们说了算了，就是冲出南海也不是问题的。
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至于说刘香，那只是小问题，只要我大军一致，保管刘香那一伙人“飞灰湮灭”，连一点渣都不待剩下的。所以诸位不必担心，只要等郑某人消灭了西班牙人，就会让刘香永远的消失，只你们交足了“保护费”，郑某人一定担保诸位的安全。
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这些代表都明白了郑芝龙的意思，郑芝龙明白的告诉了他们，眼下我郑芝龙没有功夫去搭理刘香，等我有空的时候再说，至于“保护费”，你们也得按规矩交，不然的话，不等刘香去抢你们，老子就去抢你们。所以看着办啊。
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不过郑芝龙也说，虽然眼下我没有办法，但是你们可以其找关系，请求朝廷在派遣一支水师南下，去与刘香拼命。这些代表也是没有办法，只能回去复命。商帮、江南世家听到郑芝龙这样的回复，一个个气的牙根都痒痒。
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但是没有什么好对策，谁叫人家郑芝龙在南中国海上势力庞大呢。虽然商帮、江南世家忍了下来，也按照郑芝龙说的，开始找关系，游说朝廷在派遣一支水师来清剿刘香。但是商帮、江南世家对郑芝龙却开始越发的不满了，并开始制定对付郑芝龙的计划。
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朝廷里的大员正在忙着应付蒙古人扰边行动，根本就没有什么精力来处理该死的刘香骚扰沿海，致使海上贸易不顺的问题。市舶司接连的上疏根本就没有溅起丝毫的浪花。
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随着时间的推移，商帮、江南世家的损失是越来越大，这下子他们实在是坐不住了，只能开始动用各种的关系，并不惜本钱的开始疏通关系，终于是引起了朝廷的重视，可是正当朝廷开始重视海上的问题的时候，西北的一份加紧奏章又送到朝廷里面。
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自从洪承畴被任命为陕甘总督后，开始全力的清剿西北的农民起义，再加上朝廷说不上十分得力，但是却有一定作用的赈灾行动下，西北的形式还是有一些很大的改变的，一些较大规模的农民起义很快的备镇压了下去。
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不过朝廷虽然有赈灾行为，不过由于因为官员腐败等一系列的问题，赈灾的力度并不十分的大，但这无疑给了西北民众一个活下去的希望，只要有了希望，那大部分的西北民众就不愿意再去参加叛乱的行动。
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但是因为有些官员为了政绩和自己腰包，不顾民众死活，加紧催逼钱粮，致使部分西北民众为了生存而参加农民起义军。再加上由于辽东后金努尔哈赤的叛乱，自从明万历四十六年起，朝廷开始调集包括西北在内的各镇开赴辽东平叛。但是因为朝廷腐败，将领要么懦弱无能、要么互相倾轧，致使明军兵败失地。
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而开赴辽东的西北士卒，有的侥幸逃过一劫，历经重重险阻，好不容易回到西北，但是他们的长官却因为种种原因，不允许他们归伍。而他们或者流落各地，或者为了活命而参加农民军。这样，就为农民起义军提供了虽不充足，但是却必不可缺的兵员，这就是为什么农民军屡剿不灭的原因。
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但是那些农民军的领袖也不是什么笨人，相应的，他们很聪明。他们看到那些大股的义军备朝廷剿灭以后，他们之中开始分化了，一些人动摇了，他们与朝廷暗通款曲，并且投降了明军，接受了朝廷的官职；而有的继续坚持反抗活动，决不妥协。
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但是问题正是出在这些投降了的，接受朝廷官职的起义军。他们中的一部分并不甘心这样“平庸”的活着，他们想念的是打家劫舍，洗掠县城的生活。于是他们在暗中串联勾结，准备在适当的时机再度举起叛旗。
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本来持这种看法的致使一些原起义军的头目，大多数的士卒并不愿意再过刀剑舔血的生活。不过正是由于明军的一些陈规陋习再度将他们，还有一些没有参加过起义军，但是却十分不满上官作为的一些低级军官和士卒推到了这些阴谋叛乱的人的那边。
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崇祯五年末，陕甘总督府内，陕甘总督正眉头紧皱的听着下属的汇报，汇报事情的是驻扎在陕甘的明军贺人龙部一营原起义军投降过来的人马决定再度举起叛旗，而汇报此事的就是贺人龙的副手，陈彬。
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究其原因，不外乎就是军中各级将领克扣军饷，而贺人龙也不例外，因为朝廷财政困难，军饷本就不能按时发放，再加上各级将领的克扣，致使军中怨声载道，贺人龙部也是如此，于是一些起义军头目利用军中的不满情绪，准备起事。
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但消息并没有进行严密的封锁，于是一些看不惯上官，但是却忠于朝廷的低级军官也得到了消息，于是他们就将消息通知了陈彬。
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而陈彬也是一个有野心的人，他知道。如果上告贺人龙，那自己可能就会得不到什么好处，于是他并没有通知他的上官贺人龙，而是越级到总督府，请求面见总督洪承畴。而洪承畴也明白陈彬的意思，所以洪承畴不仅勉励了陈彬一番，也许诺会对陈彬加官进爵。
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洪承畴听到消息后，也是不敢怠慢，如果要是让那些叛贼将一个营给拖走，那后果可就严重了，于是洪承畴赶紧集合自己直接所掌握的军队，快马加鞭的赶到贺人龙所部的驻地。
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而贺人龙得知总督大人突然驾临，也是非常的吃惊，于是贺人龙赶紧来到中军帐拜见总督洪承畴。贺人龙看到总督洪承畴面色很不好看，心里非常的忐忑，他不知道自己的什么小辫子被洪承畴给抓了。
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洪承畴心里是一肚子的火，见到贺人龙以后，屏退左右后，对这贺人龙就是一通的训斥，洪承畴骂完贺人龙后，就问他，你是如何安置那些投降的农民军的，你现在有多少能彻底掌握的部队。
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贺人龙听到这番话，就觉得有些不妙了，就说：我手下的部队都能掌握住啊。
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洪承畴听完后，大骂道：混蛋，还都能掌握，你知不知道，你手下的一个营的士卒都要集体反叛了！！！